Structure des protéines
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Les protéines sont des constituants essentiels des cellules. Elles sont constitués d'acides aminés essentiellement liés de façon covalente, mais dont les relations non covalentes permettent entre autre des repliements des chaînes d'acides aminés et des arrangement tridimensionnels. On distingue ainsi:
Sommaire |
Structure primaire
La structure primaire d'une protéine correspond simplement à la succession linéaire des acides aminés constituant celle-ci. Les liaisons disulfures sont également prises en compte à ce niveau. C'est le niveau des liaisons fortes en énergie (ou dites covalentes).
Structure secondaire
La structure secondaire d'une protéine prend en compte sa conformation, c'est à dire son architecture tridimensionnelle et aux relations spatiales établies entre ses atomes constitutifs. Les repliements tridimensionnelles sont influencés par des ponts hydrogènes, des interactions hydrophobes, des interactions électrostatiques et des forces de Van des Waals. Les types de structures secondaires sont limités par le caractère de liaison partiellement double de la liaison peptidique, ainsi que par la taille et la forme des radicaux des acides aminés. Certaines structures répétitives se rencontrent fréquemment dans la structure secondaire des protéines. Il s'agit des hélices alpha , des feuillets bêta et des coudes bêta . C'est le niveau des interactions faibles.
Structure tertiaire
La structure tertiaire d'une protéine permet une visualisation simplifiée de celle-ci. Les atomes ou acides aminés ne sont plus représentés individuellement, mais on met en évidence les structures secondaires. Par exemple une hélice alpha sera représentée par un cylindre, les feuillets bêta par des flèches en gras, etc.
Structure quaternaire
La structure quaternaire des protéines regroupe l'association de plusieurs monomères constituant une protéine multimérique. Les chaînes d'acides aminés individuelles sont désignées sous le nom de protomères ou sous-unités.
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