Nomenclature EC
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La nomenclature EC (EC est le sigle de Enzyme Commission numbers, la Commission des enzymes) est une classification numérique des enzymes, basée sur la réaction chimiques qu'elle catalyse.
En tant que système de nomenclature des enzymes, chaque numéro EC est associé à un nom recommandé pour l'enzyme correspondante.
Chaque code d'enzyme consiste en les lettres majuscules « EC » suivies de quatre nombres séparés par des points. Ces nombres représentent chacun une étape dans la précision de la classification de l'enzyme. Par exemple, l'enzyme tripeptide aminopeptidase a le code EC 3.4.11.4 qui est construit comme suit : 3 signifie une hydrolase (enzymes qui utilisent l'eau pour détruire une autre molécule), 3.4 signifie hydrolases agissant sur des liens peptidiques liens peptidiques, 3.4.11 implique celles qui détachent acide aminé amino-terminal d'un polypeptide et 3.4.11.4 implique celles qui détachent cet acide aminé amino-terminal d'un tripeptide.
Le niveau supérieur de cette classification est
- EC 1 Oxydoréductases : catalysent les réactions d'oxydation/réduction
- EC 2 Transférases : transfèrent un groupement fonctionnel (par exemple un groupe méthyle ou phosphate)
- EC 3 Hydrolases : catalysent l'hydrolyse de diverses liaisons
- EC 4 Lyases : brisent diverses liaisons par d'autres procédés que l'hydrolyse et l'oxydation
- EC 5 Isomérases : catalysent les réactions d'isomérisation dans une simple molécule
- EC 6 Ligases : joignent deux molécules par des liaisons covalentes
La nomenclature complète peut être vue à l'adresse http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/
Au sens strict du terme, la nomenclature EC ne spécifie pas d'enzymes, mais des réactions catalysées par des enzymes. If different enzymes (for instance from different organisms) catalyze the same reaction, then they receive the same EC number. To uniquely specify a protein by its amino acid sequence, Swiss-Prot identifiers can be used. An EC tree that is cross-linked with the corresponding Swiss-Prot entries, as well as with other databases and a Medline literature search, is available at http://www.expasy.org/enzyme/
La nomenclature des enzymes a été développée dès 1955, lorsque le Congrès International de Biochimie à Bruxelles a créé l'Enzyme Commission (Commission des Enzymes). La première version fut publiée en 1961. La version acrtuelle est la sixième, et a été publiée par l'International Union of Biochemistry and Molecular Biology (Union internationale de biochimie et de biologie moléculaire) en 1992 et contient 3 196 enzymes différentes.
Voir aussi
- Nomenclature TC (classification des protéines de transport membranaire)
- BRENDA
